液相色譜柱在使用過程中，須注意以下六點
　　1、液相色譜柱在使用前，須先用甲醇或乙腈試劑以20倍柱體積低流速沖洗，作用是使固定相能充分潤濕、碳鏈舒展*，使色譜柱的性能達到更好狀態。具體操作是，將配制好65%的乙腈/水沖洗后，把色譜柱進口端連接在色譜儀上，出口端放空（不可連上檢測器，以免污染了檢測器），以0.1ml/min~0.5ml/min的低流速將色譜柱中的清稀溶液吹干，過20分鐘后再接上檢測器，以1.0ml/min的流速，繼續沖洗2~8小時；
　　2、液相色譜儀檢測分析樣品完畢后，須沖洗c18反相液相色譜柱。尤其是流動相中含有酸或鹽時，需將c18反相液相色譜柱中的酸或鹽沖洗干凈，通常建議用10%甲醇水沖洗20倍柱體積；
　　3、若液相色譜柱處于長期閑置狀態時，要將色譜柱*沖洗，建議沖洗3-4小時以上，后保存在純有機試劑或高比例的有機試劑溶液中；
　　4、由于液相色譜柱的固定相疏水性較強，在使用過程中盡量不要使用高水相條件，若水相比例過高易引起固定相疏水塌陷，引起柱效迅速下降，甚至造成不可逆的負面影響；由于碳載量高，表現尤為明顯，建議使用過程中水相比例不超過90%；
　　5、液相色譜柱壓力升高、柱性能下降：通常為色譜柱被污染，對色譜柱進行再生處理可恢復部分柱效；
　　6、液相色譜柱壓力驟升：通常由鹽析出或篩板堵塞引起，若是鹽析出，用10%甲醇水低流速沖洗至壓力恢復即可；若判斷并非鹽析出，以純甲醇或10%甲醇水為流動相反沖色譜柱（將色譜柱反接，不接檢測器），若反沖半小時仍無效果則說明反沖無效，需尋找其他原因。